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UFR de Chimie

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Stages M2 Recherche

Master spécialité Chimie BioOrganique et BioInorganique

separateur

ChimieL'objectif de la Spécialité Chimie BioOrganique et BioInorganique (C-BOBI) est de former des chimistes capables de comprendre et de s'intégrer dans les problématiques liées au Vivant.

En effet, le fort accroissement des recherches en Science du Vivant notamment avec la biologie moléculaire demande une plus grande synergie entre le Chimiste et le Biologiste. De même, l'aspect bi-disciplinaire de cette formation répond aux exigences des thématiques liés aux domaines des Nanobiosciences.

Cette formation vise plus particulièrement à donner à l'étudiant :

  • des notions approfondies de la Chimie des Biomolécules et leurs applications ;
     
  • des Méthodes d'Etudes des Interactions Bio-moléculaires ;
     
  • du rôle primordial des Métaux dans les processus du Vivant, pour la Santé et dans l'Environnement.

Deux parcours possibles


Recherche : l'embauche directe dans le secteur Chimie se faisant principalement au niveau doctorat et postdoctorat, ce master répond naturellement à cette formation en permettant une orientation doctorale avec la voie Recherche. Les métiers visés pour les étudiants constituent en chercheur dans les laboratoires de Recherche, R&D, Universités, CNRS, CEA, INSERM, Industries dans le domaine pharmaceutique, diagnostique, et biotechnologique.
 
Professionnel : la voie Pro est réservée aux étudiants ne souhaitant pas poursuivre leurs études par un doctorat et vise à une insertion professionnelle comme cadre de laboratoire dans les PME, start-up... dans le domaine pharmaceutique, diagnostique, biotechnologique en France et à l'étranger.

Master 1


Semestre 1 : des modules communs


Lors de la 1ère année du Master Spécialité Chimie et Vivant l'étudiant suit au 1er semestre un enseignement commun à l'ensemble de cette spécialité, constitué de modules scientifiques à caractère fondamental.

Cet ensemble d'UE communes de 18 ECTS correspond à un enseignement utile à tout chimiste et est constitué des modules :

  • Méthodes d'Analyse et Spectroscopies (6 ECTS) ;
  • Chimie Expérimentale et Techniques Bibliographiques (9 ECTS) ;

et d'un module transversal (Anglais pour les étudiants n'ayant pas validé le niveau requis).

Un module optionnel Biotechnologie (6 ECTS) est proposé en option au 1er semestre pour les étudiants désireux de garder une certaine bi-disciplinarité.

Semestre 2 : la spécialisation


Le second semestre est dédié à un début de spécialisation. Ainsi, un module de Chimie Bioorganique (Chimie des Biomolécules) et un module de Chimie BioInorganique sont proposés. Cet enseignement de spécialisation peut être complété par des modules optionnels tels que mini-projet en Chimie BioOrganique ou un module de Biochimie proposé par l'UFR de Biologie.

Master 2 Recherche


L'étudiant en M2 Recherche C-BOBI doit suivre au moins 3 modules parmi les 4 modules ci-après. Celui lui garantit une spécialisation en Chimie BioOrganique ou BioInorganique. Ceci est complété par 2 modules optionnels à prendre parmi la liste des UE obligatoires ou dans la liste des UE au choix (Grandes Familles de Médicaments, Chimie des Hétérocycles, Modélisation Moléculaire ou Module du Master Science du Vivant).

Applications des Biomolécules

L'objectif de ce module est de montrer à l'étudiant les méthodes de synthèse des biomolécules telles que les oligonucléotides, peptides et oligosaccharides et leur version modifiée (synthèse supportée, synthèse enzymatique, ligation chimiosélective). Dans un second temps, diverses applications notamment en thérapeutique seront abordées (inhibition de l'expression génétique par des oligonucléotides antisens, siRNA, vaccins synthétiques, vectorisation de molécules actives...).

Méthode d'Etudes des Interactions Bio-moléculaires

L'objectif de ce module est de donner à l'étudiant les connaissances des principes de base et des différentes stratégies pour sélectionner des composés actifs, préparer des surfaces bio-fonctionnalisées, détecter et quantifier les paramètres cinétiques et thermodynamiques d'une interaction bio-moléculaire, étudier par imagerie des processus cellulaires. Les cours aborderont les méthodes nouvelles de sélection de composés actifs (screening haut débit, phage display, Selex), de préparation de bio-puces et micro-arrays, de détection et caractérisation des interactions bio-moléculaires (Biacore) et d'imagerie cellulaire.

Biocatalyse

Comment la Nature peut inspirer le Chimiste... Le cours comprend la description de la structure et du mécanisme enzymatique de métallo-enzymes impliquant l'activation de petites molécules comme O2, H2, N2 et H2O. Le mécanisme moléculaire sera appuyé par l'étude de systèmes bio-mimétiques. Dans le cas de l'activation de O2, son transport, les réactions de transfert d'oxygène et la chimie redox seront abordées. Ces grandes réactions seront aussi abordées pour leurs importances dans le cadre de la pharmacologie et le développement de nouvelles énergies. Une initiation aux principales techniques spectroscopiques sera proposée

Métaux, Environnement et Santé

Ce module donne aux étudiants les principes et les méthodes d'analyse essentiels de la spéciation des métaux et de la chimie des métaux lourds. Elle présente l'implication des métaux dans divers aspects de la vie quotidienne touchant à l'environnement (pollution, remédiation) et à la santé (diagnostic, thérapie). Des points particuliers seront développés au travers de conférences par des intervenants extérieurs.

Master 2 Professionnel

L'étudiant en M2 Professionnel C-BOBI doit suivre le module Applications des Biomolécules et le module Méthode d'Etudes des Interactions Bio-moléculaires.
L'ensemble de ces 2 modules (équivalent à 6 ECTS) est complété par une formation pratique sur les plateaux Synthèse et Caractérisation des Interactions de la Plate-Forme NanoBio (Module Projet Tutoré de 2 semaines environ en janvier). Un module Outils de l'Entreprise est également proposé dans le but de mieux faire connaître à l'étudiant le monde industriel et ses problématiques.
Ceci est complété par 2 modules optionnels à prendre parmi la liste des UE obligatoires de la voie recherche ou dans la liste des UE au choix (Grandes Familles de Médicaments, Chimie des Hétérocycles, Modélisation Moléculaire).

Projet Tutoré sur la Plate-Forme Nanobio

Ce module est réservé aux étudiants du M2 Professionnel. Dans la limite des places disponibles, elle pourra être suivi par les étudiants du M2 Recherche.

Enseignements pratiques

Les enseignements pratiques seront réalisés sur le plateau Synthèse et sur le plateau Caractérisation des Interactions de la Plate-Forme NanoBio (pôle d'innovation en NanoBiotechnologie) sur le domaine universitaire. L'étudiant aura accès aux appareils de synthèse automatisée de peptides et d'oligonucléotides ainsi qu'aux appareils de purification (chromatographie liquide haute performance). Il pourra également s'initier aux techniques d'études des interactions en utilisant notamment les appareils Biacore, ellipsométrie et QCM-D.

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